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Q&A

常见问题

  • 无参物种能否进行蛋白质组研究?

    1)先进行转录组学研究,将转录组学数据翻译成蛋?作为蛋?质组学分析的理论数据库。基于转录组数据的蛋?质组学分析得到的蛋?数据更加全?。

    2)来源于近缘物种的数据库,需要评估近缘物种的数据库全面程度,以及近源程度。

    3)通过基因组数据得到蛋?质组数据库,由基因到转录,再由转录?蛋?中间既涉及不同的RNA可变剪切?涉及到蛋?的不同装配,过程比较复杂,以此得到的的蛋?序列可信度较低,且耗时长、费?高。


  • 什么情况下选择蛋?组学分析?

    定量蛋?质组学主要是?于筛查和寻找任何因素引起的样本间的差异表达蛋白,进而对?物学功能或机理改变进?阐释。因而如果您的研究关注的是处理组与对照组、健康组与患病组、突变组与对照组,或者不同发育时期或疾病发展阶段的蛋?质改变,可以选择定量蛋?质组学进?研究。


  • 如何选择蛋?数据库?

    目前来说,用的最多的是UniProt KB(Universal Protein),是信息最丰富、资源最?的蛋白质数据库。他的数据主要来?于基因组测序项?完成后,后续获得的蛋?质序列,每?个蛋白对应?个唯?ID,同时包含了?量来自?献的蛋?质的生物功能的信息。

    其次是美国的NCBI Genebank,从公共资源中获取序列数据,主要是科研?员直接提供或来源于大规模基因组测序计划。Gene Bank数据库同?蛋?会有多种不同形式的ID,另外是注释信息较少。

    ?般情况优先推荐使?Uniprot,当研究物种在Uniprot收录蛋白较少时可使?Gene Bank数据库或其他数据库。


  • 定量蛋?组学(Label-free/iTraq(TMT)/DIA)技术如何选择?

    Label-free较可?于差异较?的样本(不同物种、不同组织部位),对仪器稳定性要求较?。

    iTRAQ和TMT较适?于同?物种同?组织类型的样本,是“共有”蛋?比较,稳定性重复性好,同?次实验受样本个数限制。

    DIA较适?于?规模样本研究,稳定性好,不受样本个数限制,需要预先建?library。


  • 外泌体是什么?研究外泌体的意义?

    外泌体是包含了复杂RNA和蛋白质的小膜泡(30-150nm),现今,其特指直径在40-100nm的盘状囊泡。所有培养的细胞类型均可分泌外泌体,且外泌体天然存在于体液中,包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁中。

    外泌体在分泌细胞和受体细胞间的穿梭介导了细胞间的?物分子传递,是不同组织细胞间信息沟通的重要媒介,外泌体通过携带来自分泌细胞的多种RNA,蛋?和脂成分,参与?谱的?理和病理过程,包括炎症反应、肿瘤转移、心血管疾病等。 随着蛋白质组学技术的快速更新 ,外泌体特异蛋?质的研究将具有巨?的前景。


  • 宏蛋?组学与哪些组学可以联合分析解释哪些问题?

    宏蛋白组可以与宏基因组、宏转录组和宏代谢组联合分析。多组学的方法能够使?们解释基本的?物学问题,如样本中都有哪些物种组成(宏基因组),哪些基因表达为mRNA(宏转录组),哪些mRNA进?步翻译为蛋白(宏蛋白组),在特定条件下哪些参与代谢的物种存在或者代谢物质的波动情况(宏代谢组)。这些方法的结合可以提供丰富的信息并可以?来进?表型模型的预防。


  • 宏蛋?组学是什么?

    宏蛋?组学是应?蛋?组学技术对微?物群落进?研究的?项新技术,在特定时间对微?物群落的所有蛋白组的组成进行大规模的鉴定。


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