针对血液中携带的蛋白质信息进行挖掘能够为疾病早诊、疾病机制理解、治疗靶点发现及个性化医疗等方面提供重要见解。十一长假刚刚结束，新一轮研究即将开展，磨刀不误砍柴工，先来看看过去一个月各领域研究者们利用血浆蛋白组发表了哪些成果，获取灵感强化自己吧。
9月13日，法国贝尔戈尼研究所团队通过空间转录组学和血浆蛋白质组学检测发现瑞戈非尼与阿维鲁单抗注射液联合治疗耐药的胃癌患者，肿瘤微环境中M2型巨噬细胞显著增多，S100A10蛋白在肿瘤细胞中显著过表达。血浆蛋白组学检测显示血浆中CSF-1、IL-4、IL-8和TWEAK等细胞因子的升高与不良预后相关。巨噬细胞的免疫抑制作用以及S100A10的过表达是影响治疗效果的关键因素。
该文章提示血浆蛋白质组与免疫治疗息息相关，能够为癌症的预后预测提供思路，指导癌症个性化治疗。
9月27日，华中科技大学同济医学院公共卫生学院刘刚团队使用英国生物样本库中包含21892例参与者共2915种血浆蛋白的蛋白质组数据分析了与8种健康饮食模式（健康低脂饮食模式、地中海饮食模式、MIND饮食模式、AHEI-2010饮食模式、DASH饮食模式、hPDI饮食模式、rE-DII饮食模式和HLCD饮食模式）相关的蛋白，发现差异蛋白与糖尿病、心血管疾病、慢性呼吸疾病、慢性肾病和癌症的风险降低及更长寿命有关，某些蛋白（如FSTL3和STC1）在饮食模式与疾病之间的关系中发挥中介作用。
该文章提示血浆蛋白质组有助于深入理解饮食与慢性疾病之间的关系，具有个性化营养干预潜力。
9月7日，西安交通大学郭燕团队通过对680名创伤后有或没有发生深静脉血栓形成的患者进行临床指标、血浆代谢组与蛋白质组检测，阐明了创伤后深静脉血栓形成的代谢特征。基于临床指标与血浆代谢组检测，该团队发现了与创伤后深静脉血栓形成相关的28种代谢物和2个临床参数，并以580例样本（252例创伤后深静脉血栓形成患者血浆vs 328例对照）为发现集，100例样本（50例创伤后深静脉血栓形成患者血浆vs 50例对照）为验证集，通过机器学习进行标志物筛选，确定了可高效预测创伤后深静脉血栓形成的9种代谢物标志物组合。基于血浆蛋白质组检测（96例创伤后深静脉血栓形成患者血浆vs 87例对照），该团队从鉴定到的524种血浆蛋白中发现了与创伤后深静脉血栓形成相关的214种蛋白质，联合代谢组数据分析，该团队发现糖酵解/糖异生-TCA循环的上调可能通过增加红细胞内活性氧（ROS）水平促进血栓形成，这表明这一代谢通路可能是创伤后深静脉血栓形成潜在的治疗靶点。
该研究提示血浆蛋白质组能够通过分析代谢通路蛋白，为代谢相关疾病提供更深刻的见解，并指示疾病潜在治疗靶点。
9月4日，英国利兹大学利兹心血管及代谢医学研究所团队使用英国生物样本库中包含53029例参与者共2923种血浆蛋白的蛋白质组数据与患者因感染而死亡的事件相关联（240个事件，52520名参与者），通过泊松回归模型评估，以发生率比（IRR）>1.5作为阈值，发现259种蛋白与感染死亡显著相关，其中46种蛋白具有可用的遗传评分。以INTERVAL队列为发现集，以NSPHS和ORCADE队列为验证集，使用蛋白质数量性状评分（pQTS）发现只有MER原癌基因酪氨酸激酶（MERTK）的pQTS与感染死亡显著相关。使用没有血浆蛋白质组学数据的363953例英国生物样本库参与者（984例感染死亡）数据对感染死亡率进行全基因组关联研究（GWAS），两样本孟德尔随机化分析表明血浆MERTK蛋白浓度增加与感染死亡率之间存在潜在因果关系。较高的MERTK浓度与较大年龄、男性及多种慢性疾病相关，MERTK与循环中的白细胞亚群和血小板计数也有关联。
善用血浆蛋白质组数据，结合基因组与孟德尔随机化，纯生物信息学内容也能发14分一区SCI~
9月12日，中国科学院动物研究所刘光慧团队与中国科学院北京基因组研究所张维绮团队及中国科学院动物研究所曲静团队合作，通过对健康的中老年雄性食蟹猴（相当于人类的40-50岁）进行40个月的二甲双胍干预（2型糖尿病临床治疗剂量），对其生理功能、医学影像、多种血液指标、多个组织病理和多器官多组织多组学进行分析，阐明长期服用二甲双胍能够显著延缓食蟹猴的衰老，对全身11个系统79种组织器官发挥全面衰老保护效果。该团队基于血浆蛋白质组学、血浆代谢组学、泛组织转录组学、DNA甲基化组学绘制了新的灵长类衰老时钟，能够用于准确预测食蟹猴生物学年龄。该研究为抗衰药物研究开辟了新的范式。
9月24日，美国明尼苏达大学研究团队通过对11761例中年参与者和5183例老年参与者的血浆蛋白质组检测（共鉴定到4712种蛋白质），使用其中2/3的样本作为发现集，1/3的样本作为验证集，通过弹性净回归构建新的蛋白质组学衰老时钟ARIC PACs，并在验证集中利用Cox比例风险回归分析了年龄加速和年龄加速变化与全因、心血管疾病、癌症和下呼吸道疾病死亡率之间的关联，发现ARIC PACs和已发表的3个衰老时钟与死亡风险增加有相似的相关性。
上述两篇文章提示衰老时钟有望成为生物学年龄的生物标志物，可作为预测病死率、评估抗衰老生活方式和治疗干预效果的工具。
通过对以上前沿文章的学习，想必大家对血浆蛋白质组的研究思路和研究方法有了更深刻的认知。马竞直播针对血浆蛋白质组研究需求，独家推出疾病标志物筛选、预后标志物筛选、分子分型、PWAS高级分析报告，助大家在科研的海洋中乘风破浪。
